জগন্নাথপুর উপজেলার অবস্থান ঢাকা-সিলেট মহাসড়ক থেকে ১৫ কিলোমিটার দূরে। মোট এলাকা 368.27 বর্গ কিমি। সিলেট জেলার বালাগঞ্জ ও বিশনাথ উপজেলা, উত্তরে ছাতক ও দক্ষিণ সুনামগঞ্জ উপজেলা, পশ্চিমে দিরাই এবং জগন্নাথপুর উপজেলার দক্ষিণ-পূর্বে হবিগঞ্জ জেলার নবীগঞ্জ উপজেলা। উপজেলা প্রধান অক্ষাংশ 24.771664 এবং দ্রাঘিমাংশ 91.545077 বিভাগীয় শহর সিলেট এবং জেলা শহর সুনামগঞ্জের মধ্যে দূরত্ব 44 কিমি। জগন্নাথপুর উপজেলার সাথে উভয় শহরের সড়ক যোগাযোগ রয়েছে
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস